Η Ενορία του Αγίου Σεραφείμ Επισκόπου Φαναρίου Πεντέλης δημιουργήθηκε, αποσπασθείσα από την Ενορία Αγίας Παρασκευής Νέας Πεντέλης, στις 3 Ιουνίου 1975 με το υπ’ αριθμόν 381 Προεδρικό Διάταγμα υπό του Προέδρου της Δημοκρατίας Μιχαήλ Στασινόπουλου (ΦΕΚ 117/Α/1975). Τα όρια της Ενορίας του Αγίου Σεραφείμ Επισκόπου Φαναρίου Πεντέλης καταλαμβάνουν το σύνολο της Δ.Κ. Πεντέλης.

Στις 5 Ιουλίου 1980 εκδόθηκε το υπ’ αριθμόν 609 Προεδρικό Διάταγμα υπό του Προέδρου της Δημοκρατίας Κωνσταντίνου Καραμανλή (ΦΕΚ 162/Α/1980) με το οποίο η Ενορία Αγίου Σεραφείμ Επισκόπου Φαναρίου Πεντέλης μετονομάζεται σε Ενορία Αγίου Σεραφείμ Επισκόπου Φαναρίου και Προφήτου Ηλία Πεντέλης.

Ο Ιερός Ναός Αγίου Σεραφείμ Επισκόπου Φαναρίου και Προφήτου Ηλία Πεντέλης θεμελιώθηκε το 1975 και συνεχίζεται η ανοικοδόμηση. Το οικόπεδο στο οποίο βρίσκεται ο Ιερός Ναός δωρίθηκε από την Ιερά Μονή Κοιμήσεως της Θεοτόκου Πεντέλης επί Ηγουμενίας του Θεοφιλεστάτου Επισκόπου (νυν Μητροπολίτου) Δωδώνης Χρυσοστόμου Συνετού.

Από της ιδρύσεως της Ενορίας μέχρι και την αποπεράτωση του ισογείου Ιερού Ναού ως Ενοριακός Ναός χρησιμοποιήθηκε ο Ιερός Ναός της Αγίας Τρίαδος που βρίσκεται στην πλατεία Πεντέλης και ανήκει στην  Ιερά Μονή Κοιμήσεως της Θεοτόκου Πεντέλης.

Το 2017 δημιουργήθηκε το Παρεκκλήσιο του Αγίου Πορφυρίου του Καυσοκαλυβίτου στο νότιο κλίτος του ισογείου Ναού.